92,3 % de la population est de confession catholique et seuls 3 % des habitants se déclarent sans religion. Cette prédominance de l’Église catholique romaine se retrouve dans le paysage architectural de la République, qui compte plusieurs églises, ainsi qu’une basilique monumentale. Le territoire de la République dépend du diocèse de San Marino-Montefeltro dont la juridiction s’étend sur une partie des provinces italiennes voisines.