La religion dominante du territoire est la religion catholique pour la majeure partie des habitants. Actuellement, l’archipel est pour l’Église catholique un vicariat apostolique. L’exégète catholique Simon Légasse, de l’Ordre des frères mineurs capucins, est originaire de Saint-Pierre.

Les évangéliques disposent d’un lieu de culte, et les Témoins de Jéhovah du leur, construit en août 2013. Les autres habitants du territoire peuvent aussi jouir de la cathédrale Saint-Pierre de Saint-Pierre-et-Miquelon